En Alsace, l'activité s’appuie sur la mise en place d’expérimentation essentiellement sur les cultures de maïs et de blé. Chaque année, des essais spécifiques sont implantés en fonction des besoins (lutte contre l’helminthosporiose du maïs, les ravageurs du sol,…) Ces références sont ensuite valorisées sous forme d’actions de communication, de formation et d’expertise auprès des agriculteurs et des organismes de la région (Chambres d'Agriculture, Coopératives, Négociants,…)
En outre, un site instrumenté de suivi de la qualité de l’eau, situé à Geispitzen, permet d’analyser les eaux de ruissellement sur un dispositif comparé de trois grandes parcelles de maïs.
Enfin l’équipe d’Alsace développe de nombreux échanges et partenariat avec des collègues transfrontaliers et Allemands.
La commission régionale, composée de 25 agriculteurs, examine régulièrement les activités d’ARVALIS en région et propose des orientations tant en matière d’axe de recherche que sur la communication. Elle est présidée par Christian SCHNEIDER.